东海水产研究所图书馆创立于建所之初，1963年迁入现址。馆内收藏水产科学各专业的中、外文期刊400多种，图书5万余册。文献主要涉及鱼类学、水产养殖、海洋渔业及资源、水生生物学、渔业环境保护、水产品加工等专业和学科，可为水产科技工作者以及其它专业人员提供参考消息和相关信息。

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　　《海洋渔业》是中国水产学会和中国水产科学研究院东海水产研究所主办的学术性期刊，创刊于1979年。主要刊载水产资源和捕捞、水产养殖和增殖、水产品保鲜与综合利用、渔业水域环境保护、渔业机械与仪器以及水产基础研究的论文、综述和简报，国内外公开发行。

　　《现代渔业信息》（月刊）是供全国农、林、水系统各级领导、高等院校教师、科研人员以及生产单位工作者参阅的渔业科技综合性信息刊物，被评为全国水产系统和上海市优秀刊物，1993年被美国收入国际期刊名录，面向国内外公开发行。